Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL9A3Q14050 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL9A3Q14050 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL9A3Q14050 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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