Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
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COL4A6Q14031 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL4A6Q14031 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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