Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCINQ13939 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCINQ13939 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms