Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
TUBA3CQ13748 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms