Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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