Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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