Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDE3BQ13370 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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