Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
AP3B2Q13367 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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