Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGB3BPQ13352 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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ITGB3BPQ13352 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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