Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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