Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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