Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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