Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms