Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NMBRP28336 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NMBRP28336 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NMBRP28336 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NMBRP28336 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NMBRP28336 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NMBRP28336 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms