Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPREP23469 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPREP23469 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPREP23469 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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