Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
EHD3Q9NZN3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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