Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.8 ms