Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
RBM42Q9BTD8 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RBM42Q9BTD8 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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