Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MS4A6EQ96DS6 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MS4A6EQ96DS6 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms