Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PLD3Q8IV08 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms