Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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CCDC142Q17RM4 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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