Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPN21Q16825 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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