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| PTPN21 | Q16825 | AC007271.1-201 | ENST00000428188 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC002386.1-201 | ENST00000436714 | 398 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC133134.1-201 | ENST00000466800 | 359 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC008869.1-201 | ENST00000510938 | 442 nt | TSL 2 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC100801.1-202 | ENST00000518266 | 371 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC026462.3-202 | ENST00000564361 | 515 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL359962.2-201 | ENST00000610044 | 303 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC110774.1-201 | ENST00000623567 | 2018 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | LRRC70-201 | ENST00000334994 | 2249 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NETO1-202 | ENST00000397929 | 1849 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | FOXP2-206 | ENST00000393491 | 6085 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | VSTM2A-OT1-201 | ENST00000456049 | 3031 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP432-201 | ENST00000362480 | 116 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP383-201 | ENST00000362934 | 120 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-487P-201 | ENST00000365430 | 104 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1297P-201 | ENST00000384415 | 104 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR517A-201 | ENST00000385001 | 87 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC005160.1-201 | ENST00000432405 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | DAP3P1-201 | ENST00000441522 | 278 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL138900.1-201 | ENST00000449345 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | PTPRG-AS1-210 | ENST00000498655 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC114801.2-201 | ENST00000503825 | 781 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6ATAC13P-201 | ENST00000516152 | 131 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC008083.3-202 | ENST00000552063 | 277 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC006557.5-201 | ENST00000603126 | 811 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC013412.1-201 | ENST00000610687 | 192 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR6715A-201 | ENST00000615929 | 79 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NEB-201 | ENST00000172853 | 20634 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CUL3-204 | ENST00000409777 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MS4A14-202 | ENST00000395001 | 3401 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NBPF20-201 | ENST00000369373 | 18760 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MBNL1-206 | ENST00000357472 | 5256 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MBNL1-223 | ENST00000498502 | 5258 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| PTPN21 | Q16825 | KIAA0825-203 | ENST00000513200 | 4942 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | DICER1-203 | ENST00000526495 | 10331 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZBTB20-201 | ENST00000357258 | 27125 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1317P-201 | ENST00000364582 | 104 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MTND4P28-201 | ENST00000426217 | 387 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC009414.1-201 | ENST00000427200 | 443 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC007566.1-201 | ENST00000427458 | 643 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL136369.1-201 | ENST00000437825 | 244 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | OSTCP8-201 | ENST00000445117 | 448 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.632-201 | ENST00000459189 | 102 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP217-201 | ENST00000515959 | 91 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU5B-3P-201 | ENST00000516601 | 115 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA31.18-201 | ENST00000517043 | 134 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA31.23-201 | ENST00000517219 | 133 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| PTPN21 | Q16825 | IGHV3-76-201 | ENST00000522465 | 295 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |