Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms