Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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