Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms