Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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UBE4AQ14139 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBE4AQ14139 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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