Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
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