Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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ATP1A4Q13733 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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ATP1A4Q13733 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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ATP1A4Q13733 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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ATP1A4Q13733 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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ATP1A4Q13733 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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ATP1A4Q13733 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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