Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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