Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
XRCC4Q13426 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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