Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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SEMA3FQ13275 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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