Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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