Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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