Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KCNMA1Q12791 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms