Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms