Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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