Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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