Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms