Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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