Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPRR3Q9UBC9 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms