Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms