Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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