Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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