Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms