Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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