Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms