Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNAPC1Q16533 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNAPC1Q16533 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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