Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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