Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms