Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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E2F4Q16254 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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E2F4Q16254 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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E2F4Q16254 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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E2F4Q16254 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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